More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45504 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45504  predicted protein  100 
 
 
373 aa  769    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389982  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
301 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 
317 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
324 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
312 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
317 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  30.96 
 
 
308 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  28.53 
 
 
309 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  32.53 
 
 
300 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
307 aa  95.9  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
298 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  27.99 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  32.14 
 
 
301 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.51 
 
 
328 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
326 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 
316 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 
303 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  27.67 
 
 
309 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
328 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.93 
 
 
329 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.25 
 
 
300 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
288 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  32.53 
 
 
333 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
271 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  30.03 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  32.53 
 
 
329 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  30.37 
 
 
306 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 
316 aa  89.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
290 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
280 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.18 
 
 
289 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.18 
 
 
289 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.18 
 
 
289 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
313 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
287 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
328 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 
303 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.74 
 
 
314 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.79 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  29.55 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  29.11 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.01 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  28.01 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  27.91 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  28.1 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 
305 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  31.58 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
314 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.62 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  32.16 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  27.82 
 
 
320 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  32.02 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2507  short chain dehydrogenase  29.64 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  30.07 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4041  short chain dehydrogenase  29.5 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138801  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  29.54 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.3 
 
 
309 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  29.41 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  33.19 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>