More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44627 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44627  predicted protein  100 
 
 
652 aa  1343    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.92 
 
 
426 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  38.83 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  37.93 
 
 
329 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  37.4 
 
 
329 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.88 
 
 
350 aa  196  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.16 
 
 
437 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  37.09 
 
 
422 aa  194  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  37.44 
 
 
435 aa  193  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  37.47 
 
 
435 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  37.67 
 
 
359 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.99 
 
 
429 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  34.31 
 
 
500 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  37.04 
 
 
329 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  37.04 
 
 
329 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.24 
 
 
454 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.05 
 
 
348 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 
336 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  36.68 
 
 
439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  38.32 
 
 
353 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.86 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  36.02 
 
 
427 aa  185  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  38.11 
 
 
397 aa  184  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.71 
 
 
464 aa  183  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  37.21 
 
 
339 aa  183  9.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  33.92 
 
 
423 aa  181  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  37.65 
 
 
354 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  37.33 
 
 
338 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.01 
 
 
425 aa  181  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  37.65 
 
 
354 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  39.63 
 
 
326 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.61 
 
 
344 aa  180  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  34.44 
 
 
343 aa  180  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  34.35 
 
 
366 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  38.12 
 
 
344 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  36.8 
 
 
349 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.14 
 
 
342 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  38.6 
 
 
351 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  37.35 
 
 
354 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  38.84 
 
 
338 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  34.74 
 
 
356 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  37 
 
 
327 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  39.44 
 
 
329 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  36.5 
 
 
450 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.53 
 
 
439 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  36.7 
 
 
327 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.95 
 
 
482 aa  177  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  40.48 
 
 
352 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  36.2 
 
 
358 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  38.46 
 
 
342 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  36.2 
 
 
358 aa  177  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  38.67 
 
 
392 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  38.07 
 
 
392 aa  177  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  36.27 
 
 
516 aa  177  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.55 
 
 
464 aa  177  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  34.27 
 
 
440 aa  177  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.45 
 
 
342 aa  177  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  39.45 
 
 
338 aa  177  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  36.6 
 
 
390 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  36.02 
 
 
340 aa  176  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  37.61 
 
 
348 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  35.96 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  34.39 
 
 
493 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  34.45 
 
 
346 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  37.05 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.99 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  36.34 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.61 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.52 
 
 
343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  39.94 
 
 
372 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.71 
 
 
368 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  39.88 
 
 
397 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.92 
 
 
517 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  32.89 
 
 
327 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.63 
 
 
344 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.75 
 
 
491 aa  173  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  35.15 
 
 
327 aa  173  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.02 
 
 
344 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.02 
 
 
344 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  36.13 
 
 
370 aa  173  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  35.38 
 
 
356 aa  173  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.78 
 
 
463 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  35.68 
 
 
386 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  35.4 
 
 
389 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  42.62 
 
 
342 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  42.21 
 
 
359 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  38.11 
 
 
345 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  36.58 
 
 
353 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  36.8 
 
 
353 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  42.62 
 
 
342 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.38 
 
 
438 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  36.1 
 
 
519 aa  173  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  36.43 
 
 
392 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  39.82 
 
 
370 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  34.7 
 
 
336 aa  172  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  36.98 
 
 
358 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.14 
 
 
426 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.69 
 
 
390 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.54 
 
 
348 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  35.06 
 
 
353 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>