239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37572 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_37572  predicted protein  100 
 
 
977 aa  1993    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.421794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
221 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 
452 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1577  hypothetical protein  43.53 
 
 
98 aa  78.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.788933  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0335  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1049  hypothetical protein  44.87 
 
 
98 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48859  predicted protein  47.3 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0728066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2455  hypothetical protein  44.16 
 
 
99 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 
211 aa  70.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 
209 aa  68.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.4 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  29.06 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0697  hypothetical protein  36.99 
 
 
105 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
219 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
447 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 
188 aa  65.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
190 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
243 aa  65.1  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
203 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
449 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
445 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
221 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
214 aa  63.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
220 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 
442 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.64 
 
 
442 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  25.71 
 
 
200 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
205 aa  63.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
214 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
447 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
201 aa  62.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
221 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
221 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.85 
 
 
442 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
194 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  25.48 
 
 
203 aa  62.4  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  32 
 
 
202 aa  62  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
459 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
220 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.28 
 
 
442 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  26.05 
 
 
340 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
207 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.79 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14414  predicted protein  28.8 
 
 
799 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
220 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
234 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  30.06 
 
 
189 aa  59.3  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
200 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 
223 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
212 aa  58.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  26.23 
 
 
208 aa  58.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  26.97 
 
 
224 aa  58.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  26.44 
 
 
207 aa  57.4  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.24 
 
 
220 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.24 
 
 
220 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.76 
 
 
229 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  27.8 
 
 
229 aa  56.6  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
216 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.86 
 
 
205 aa  56.6  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
220 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
220 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
220 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
214 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  30.24 
 
 
229 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.14 
 
 
442 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.3 
 
 
444 aa  55.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
214 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 
204 aa  56.2  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34127  putative phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
225 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.375403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  31.66 
 
 
214 aa  56.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08641  hypothetical protein  34.33 
 
 
102 aa  55.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  24.53 
 
 
207 aa  55.5  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
240 aa  55.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
249 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
212 aa  55.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.4 
 
 
442 aa  55.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 
233 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  25.35 
 
 
201 aa  54.7  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  25.35 
 
 
201 aa  54.7  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.09 
 
 
207 aa  54.7  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
211 aa  54.7  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 
210 aa  54.7  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.52 
 
 
443 aa  54.7  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  30.07 
 
 
217 aa  54.3  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41063  predicted protein  36.18 
 
 
174 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123824  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 
197 aa  54.3  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 
232 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.06 
 
 
227 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 
216 aa  53.5  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
218 aa  53.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 
216 aa  53.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
190 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 
213 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 
210 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
226 aa  53.5  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
210 aa  53.5  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  44.12 
 
 
195 aa  52.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  24.77 
 
 
212 aa  52.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>