More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13107 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13107  predicted protein  100 
 
 
170 aa  355  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  50.35 
 
 
359 aa  161  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  51.97 
 
 
164 aa  153  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  48.03 
 
 
162 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
163 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  48.34 
 
 
156 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.66 
 
 
290 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  44.76 
 
 
177 aa  147  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  44.52 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  46.94 
 
 
735 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  46.94 
 
 
405 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  50.66 
 
 
246 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  46.67 
 
 
397 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  47.62 
 
 
158 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.27 
 
 
178 aa  143  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14769  predicted protein  48.21 
 
 
160 aa  143  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  45.27 
 
 
183 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 
165 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  46 
 
 
162 aa  141  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  43.05 
 
 
320 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.33 
 
 
334 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  49.67 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  43.62 
 
 
211 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  49.67 
 
 
212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  49.67 
 
 
212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8683  predicted protein  45.35 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 
219 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 
184 aa  137  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  43.71 
 
 
158 aa  137  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  47.3 
 
 
223 aa  137  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  49.01 
 
 
212 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 
177 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  46.1 
 
 
191 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  42.67 
 
 
416 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 
155 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.52 
 
 
284 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.52 
 
 
186 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  44.9 
 
 
150 aa  136  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  46 
 
 
181 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.52 
 
 
284 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  43.15 
 
 
375 aa  136  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  49.01 
 
 
212 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  44.74 
 
 
394 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  43.33 
 
 
186 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  50.68 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  43.05 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  43.92 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  42.28 
 
 
214 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42 
 
 
416 aa  134  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 
178 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  42.57 
 
 
211 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 
213 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  42.96 
 
 
170 aa  134  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.54 
 
 
321 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
213 aa  134  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  44.06 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  44.06 
 
 
368 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  42.95 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  43.97 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  43.84 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.52 
 
 
338 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  41.78 
 
 
323 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  44.06 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  43.62 
 
 
380 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  41.33 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  36.9 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  42.66 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.21 
 
 
334 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
182 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  43.62 
 
 
177 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1311  methionine sulfoxide reductase A  48.32 
 
 
237 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.518036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  41.96 
 
 
157 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  44.22 
 
 
328 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  40.67 
 
 
266 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  42.57 
 
 
179 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  43.45 
 
 
228 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17771  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 
239 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.417292 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  44.52 
 
 
178 aa  131  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 
260 aa  131  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
212 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  38.79 
 
 
178 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  42.57 
 
 
181 aa  131  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  46.36 
 
 
212 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  46.26 
 
 
218 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  47.68 
 
 
212 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  38.79 
 
 
178 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  40.94 
 
 
198 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
212 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  47.68 
 
 
212 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  47.68 
 
 
212 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  38.79 
 
 
178 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43507  predicted protein  47.1 
 
 
256 aa  130  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.122469 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  43.45 
 
 
184 aa  130  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>