More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1760 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1760  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  41.15 
 
 
257 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  33.95 
 
 
258 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  40.55 
 
 
249 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  38.28 
 
 
245 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  36.54 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  35.71 
 
 
249 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.58 
 
 
258 aa  127  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  38.92 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  38.32 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  39.8 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  38.94 
 
 
275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 
257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
255 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  33.81 
 
 
249 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  31.58 
 
 
288 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  37.5 
 
 
244 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  34.42 
 
 
258 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  34.93 
 
 
258 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  34.93 
 
 
258 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0292  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
248 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  39.25 
 
 
250 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
256 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  39.81 
 
 
250 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
230 aa  122  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
287 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  37.56 
 
 
243 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  37.8 
 
 
236 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0656  ABC transporter related  41.43 
 
 
247 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0671  ABC transporter related  41.43 
 
 
247 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000490679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  33.66 
 
 
240 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.6 
 
 
243 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  33.66 
 
 
240 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
255 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 
256 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
256 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
256 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 
256 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  35.55 
 
 
258 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  33.49 
 
 
264 aa  121  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  35.98 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  37.38 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.49 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  36.89 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
256 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  36.89 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  34.93 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  35 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  36.89 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
250 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
255 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  34.76 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  34.13 
 
 
259 aa  118  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
256 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
256 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  36.71 
 
 
252 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  30.95 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  37.8 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  34.62 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  30.77 
 
 
256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  33.96 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
249 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  34.23 
 
 
252 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  36.23 
 
 
252 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 
249 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  36.04 
 
 
250 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  37.44 
 
 
254 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  32.54 
 
 
252 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  37.11 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  38.05 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  35.38 
 
 
250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  37.11 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  32.71 
 
 
249 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  38.54 
 
 
252 aa  115  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 
256 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
245 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  38.97 
 
 
250 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  36.45 
 
 
251 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  33.95 
 
 
246 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  34.56 
 
 
248 aa  114  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  37.11 
 
 
244 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  34.78 
 
 
263 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  34.3 
 
 
250 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 
251 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.71 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  36.89 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.93 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  35.5 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  32.06 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  35.12 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  31.22 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>