45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0788 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1813    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  29.5 
 
 		 853 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  30.66 
 
 		 856 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  29.03 
 
 		 848 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  27.6 
 
 		 855 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  27.45 
 
 		 828 aa  276  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  25.18 
 
 		 843 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  24.72 
 
 		 841 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  24.27 
 
 		 839 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  22 
 
 		 853 aa  204  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  25.77 
 
 		 857 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  23.3 
 
 		 838 aa  181  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  22.8 
 
 		 831 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  21.61 
 
 		 814 aa  88.2  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  19.8 
 
 		 829 aa  71.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  19.11 
 
 		 811 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  21.39 
 
 		 816 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 902 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  28.23 
 
 		 833 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  21.79 
 
 		 849 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1059 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1084 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1060 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 814 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 998 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  24.01 
 
 		 925 aa  48.1  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  22.81 
 
 		 828 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  32.52 
 
 		 914 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 791 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 829 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  29.5 
 
 		 1111 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  35.19 
 
 		 800 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1073 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 779 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 996 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 775 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 831 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1202 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  27.74 
 
 		 748 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 817 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 760 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 991 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1119 aa  44.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  31.07 
 
 		 1051 aa  44.3  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 753 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>