More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2001 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.03 
 
 		 309 aa  634    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 309 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.02 
 
 		 311 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.3 
 
 		 310 aa  514  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  76.38 
 
 		 313 aa  511  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.08 
 
 		 310 aa  485  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  57.93 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  47.9 
 
 		 341 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  49.13 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  47.19 
 
 		 301 aa  288  6e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  46.75 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  46.75 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  42.77 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  47.06 
 
 		 306 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  46.9 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  46.02 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  45.67 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  44.81 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  35.65 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  35.65 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  29.68 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 339 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  26.19 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  26.61 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  26.32 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  26.32 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  25.2 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  25.91 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  25.2 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.8 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  25.51 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.45 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  25.64 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  25.2 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 336 aa  75.5  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.02 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  23.98 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.77 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  24.31 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  24.31 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  24.31 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.05 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.32 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  23.2 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>