44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3250 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  92.61 
 
 		 406 aa  734    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  100 
 
 		 406 aa  833    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  75.49 
 
 		 409 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  40.89 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  40.89 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  38.48 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  33.13 
 
 		 495 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  36.41 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  39.77 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  40 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  39.77 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  37.65 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  37.65 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  47.09 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  24.64 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  35.2 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  27.03 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  24.57 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  25.97 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  35.34 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  37 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  37 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  27.54 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  29.1 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  30.86 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  25.86 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  26.63 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  20.84 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  25.47 
 
 		 180 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  20.05 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  22.67 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  27.12 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  31.53 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  22.04 
 
 		 458 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  23.43 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  31.73 
 
 		 541 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  32.63 
 
 		 108 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  24.07 
 
 		 604 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  25.12 
 
 		 572 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  24.28 
 
 		 565 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  23.23 
 
 		 554 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  22.42 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>