109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0348 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  63.54 
 
 		 469 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  73.62 
 
 		 470 aa  734    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  76.17 
 
 		 470 aa  766    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 		 469 aa  978    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  89.98 
 
 		 469 aa  890    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  56.99 
 
 		 469 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  54 
 
 		 467 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  46.07 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  44.35 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  40.99 
 
 		 490 aa  340  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.48 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.26 
 
 		 494 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.26 
 
 		 494 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  39.36 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.61 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.15 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.15 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  37.95 
 
 		 487 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  39.36 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.26 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  40.68 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  41.23 
 
 		 546 aa  324  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  41.39 
 
 		 454 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.15 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.01 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  38.24 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  37.8 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  38.53 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.65 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.84 
 
 		 480 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.76 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.68 
 
 		 493 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.26 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.09 
 
 		 493 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  38.49 
 
 		 492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.28 
 
 		 491 aa  262  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.5 
 
 		 532 aa  256  6e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  34.05 
 
 		 491 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.85 
 
 		 499 aa  246  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.91 
 
 		 480 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.24 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.29 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.79 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  29.76 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.87 
 
 		 518 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.29 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.8 
 
 		 705 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  31.04 
 
 		 740 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  32.66 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.18 
 
 		 482 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  33.1 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  31.58 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.75 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.3 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  27.97 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.52 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  28.54 
 
 		 738 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.69 
 
 		 506 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.8 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.02 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.17 
 
 		 787 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.89 
 
 		 476 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  30.51 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  30.68 
 
 		 526 aa  136  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  26.63 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  30.84 
 
 		 473 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  27.88 
 
 		 1203 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  27.72 
 
 		 566 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  27.51 
 
 		 572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  28.99 
 
 		 546 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  29.13 
 
 		 545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  28.51 
 
 		 1413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.76 
 
 		 464 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  29.71 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  28.94 
 
 		 545 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  28.29 
 
 		 545 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.16 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  28.6 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  28.12 
 
 		 1220 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  28.33 
 
 		 497 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  29.85 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.45 
 
 		 754 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  28.6 
 
 		 557 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.15 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.29 
 
 		 566 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  29.19 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.24 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  29.19 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  28.99 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  28.99 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  28.99 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  28.99 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  26.07 
 
 		 576 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  28.78 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  27.03 
 
 		 507 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.89 
 
 		 818 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  26.77 
 
 		 544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  28.17 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.18 
 
 		 851 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.18387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>