More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13041 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  48.83 
 
 		 972 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  48.83 
 
 		 972 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  59.84 
 
 		 985 aa  1204    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  59.47 
 
 		 986 aa  1184    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  63.92 
 
 		 986 aa  1261    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  85.04 
 
 		 976 aa  1710    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  48.63 
 
 		 977 aa  868    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  58.47 
 
 		 998 aa  1195    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  59.88 
 
 		 986 aa  1206    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  85.04 
 
 		 976 aa  1706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  49.85 
 
 		 953 aa  901    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  47.15 
 
 		 966 aa  837    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  85.14 
 
 		 976 aa  1701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  100 
 
 		 976 aa  1984    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  45.16 
 
 		 1045 aa  820    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  45.07 
 
 		 982 aa  824    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  63.72 
 
 		 986 aa  1256    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  47.77 
 
 		 982 aa  849    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 951 aa  606  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 893 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37 
 
 		 912 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.42 
 
 		 891 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 903 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 915 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  35.94 
 
 		 906 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.89 
 
 		 903 aa  581  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.6 
 
 		 892 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.05 
 
 		 891 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  36.31 
 
 		 917 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 917 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 899 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 906 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 926 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 899 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  34.69 
 
 		 934 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 908 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 892 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  37.66 
 
 		 944 aa  572  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 888 aa  571  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 926 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 941 aa  572  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 923 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 926 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  36.82 
 
 		 916 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 926 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 931 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 892 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  36.15 
 
 		 939 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 917 aa  572  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 911 aa  571  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 926 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 934 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 923 aa  569  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 917 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 892 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 943 aa  569  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 923 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 950 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  38.09 
 
 		 935 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 943 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 913 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 917 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 933 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  35.22 
 
 		 926 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 913 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 917 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 924 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 917 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.44 
 
 		 930 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 945 aa  558  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 942 aa  559  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 893 aa  558  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  36.39 
 
 		 923 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 936 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 930 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  35.47 
 
 		 917 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  35.91 
 
 		 905 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  36 
 
 		 910 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  36.82 
 
 		 908 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.58 
 
 		 913 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.26 
 
 		 949 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 915 aa  552  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 896 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  36.05 
 
 		 896 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 928 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 893 aa  552  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 934 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 956 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 934 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 911 aa  549  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  35.6 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  36.45 
 
 		 896 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  36.03 
 
 		 941 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 992 aa  544  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.85 
 
 		 940 aa  545  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 928 aa  545  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  34.57 
 
 		 947 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>