More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11841 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  100 
 
 		 335 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  86.57 
 
 		 335 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  85.24 
 
 		 335 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  87.58 
 
 		 314 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  70.44 
 
 		 332 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  68.35 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  68.27 
 
 		 345 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  66.13 
 
 		 335 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  66.35 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  66.13 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  60.77 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  56.47 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  56.07 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  56.13 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  57.69 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  57.69 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  56.39 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  56.39 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  56.39 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  58.06 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  56.39 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  56.39 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  56.39 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  52.8 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  56.39 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  56.07 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  53.16 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  53.44 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  55.88 
 
 		 337 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  53.27 
 
 		 364 aa  361  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  52.87 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  56.72 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  56.72 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  56.72 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  56.72 
 
 		 339 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  53.9 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  56.25 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  56.07 
 
 		 339 aa  355  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  52.19 
 
 		 375 aa  355  5.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  56.07 
 
 		 339 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  56.07 
 
 		 340 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  54.43 
 
 		 360 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  51.59 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  54.34 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  53.5 
 
 		 437 aa  353  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  52.1 
 
 		 368 aa  352  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  54.43 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  53.77 
 
 		 351 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  53.72 
 
 		 320 aa  351  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  53.11 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  53.11 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  52.06 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  53.16 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  52.05 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  52.38 
 
 		 338 aa  345  5e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  51.08 
 
 		 374 aa  345  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  52.79 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  50.97 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  50 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  50 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  55 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  50.65 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  50.65 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  50.96 
 
 		 331 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  56.1 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  52.06 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  52.26 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  52.26 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  51.13 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  52.26 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  52.56 
 
 		 354 aa  338  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  52.56 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  50.31 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  51.15 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  49.85 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  50.97 
 
 		 353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  50.63 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  48.45 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  50.16 
 
 		 352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  51.8 
 
 		 346 aa  335  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  51.29 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  51.29 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  50.16 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  51.92 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  49.04 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  50.16 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  49.84 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  51.3 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  51.13 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  49.53 
 
 		 352 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  54 
 
 		 342 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  51.29 
 
 		 350 aa  332  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  51.69 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  50.97 
 
 		 346 aa  332  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  49.07 
 
 		 352 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  52.13 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  51.15 
 
 		 350 aa  332  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  50.97 
 
 		 346 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  50.97 
 
 		 346 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  50.97 
 
 		 346 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>