More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02011 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  96.96 
 
 		 395 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  100 
 
 		 395 aa  819    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  90.38 
 
 		 394 aa  750    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  78.48 
 
 		 394 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  75.19 
 
 		 394 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  75.44 
 
 		 394 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  89.62 
 
 		 394 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2432  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  90.13 
 
 		 394 aa  745    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0877111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  97.47 
 
 		 395 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  82.03 
 
 		 394 aa  691    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  79.49 
 
 		 394 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  90.13 
 
 		 394 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  97.22 
 
 		 395 aa  802    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  79.49 
 
 		 394 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  90.63 
 
 		 394 aa  752    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  77.47 
 
 		 394 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  91.39 
 
 		 394 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  74.94 
 
 		 394 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  46.91 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  45.24 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.27 
 
 		 793 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.5 
 
 		 794 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.25 
 
 		 792 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  45.8 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  43.73 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  45.55 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.53 
 
 		 794 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.99 
 
 		 787 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.73 
 
 		 791 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.55 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.38 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  44.07 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  44.04 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.78 
 
 		 794 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  43.04 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  333  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  333  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  43.04 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  43.04 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  42.27 
 
 		 366 aa  332  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 		 392 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  43.15 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.34 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.58 
 
 		 422 aa  329  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.9 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.79 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  40.36 
 
 		 408 aa  323  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  42.28 
 
 		 409 aa  322  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.96 
 
 		 404 aa  322  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.22 
 
 		 403 aa  322  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.56 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.46 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.6 
 
 		 601 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  42.89 
 
 		 408 aa  319  6e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  41.51 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.31 
 
 		 608 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.64 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.07 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.18 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.86 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.08 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.53 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.3 
 
 		 587 aa  315  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  41.34 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.07 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.55 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0102  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.46 
 
 		 580 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  40.8 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  39.41 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  41.88 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  40.8 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  40 
 
 		 390 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4069  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.85 
 
 		 581 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.13 
 
 		 413 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1691  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.79 
 
 		 580 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.615733  normal  0.942549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  40.51 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  40.84 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.77 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  40.92 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  39.62 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  40.78 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  40.33 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>