More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29261 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29261  ABC transporter  100 
 
 		 258 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1606  ABC transporter  73.54 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0233225 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1366  ABC transporter  72.88 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19021  ABC transporter  50.4 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.49622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1032  manganese ABC transporter  49.21 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15251  ABC transporter  48 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11231  ABC transporter  48.77 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11311  ABC transporter  47.98 
 
 		 261 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1040  ABC transporter  47.58 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11311  ABC transporter  47.95 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  36.64 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  35.17 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  38.66 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.17 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  35.17 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  35.17 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  35.17 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.69 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.69 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.17 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  33.9 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.39 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  26.34 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  25.93 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  27.24 
 
 		 292 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.74 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  26.07 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  26.5 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  26.5 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.74 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.94 
 
 		 286 aa  95.1  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  27.35 
 
 		 297 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  27.35 
 
 		 297 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  27.35 
 
 		 297 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  27.51 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  24.8 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  28.4 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.32 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.32 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.32 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  31.33 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  26.32 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  25.97 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  29.1 
 
 		 290 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  29.1 
 
 		 290 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  23.39 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.35 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  24.51 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  28.06 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  30.54 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  24.36 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  24.36 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  28.14 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.73 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  28.33 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  26.46 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  26.07 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  28.75 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  26.2 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.88 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  26.47 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  26.07 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  25.42 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  24.05 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  27.35 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  30.4 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  26.46 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  26.1 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  33.77 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  26.25 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  26.44 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  27.8 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  26.64 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  24.15 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  26.67 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  26.85 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  28.42 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  27.8 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>