More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06951 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  100 
 
 
592 aa  1218    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  33.03 
 
 
530 aa  233  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  32.76 
 
 
509 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  33.2 
 
 
526 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  33 
 
 
491 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  33 
 
 
491 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  33 
 
 
491 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  32.53 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  32.67 
 
 
491 aa  200  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  31.77 
 
 
519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  31.47 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  32.86 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  32.07 
 
 
491 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  32.27 
 
 
491 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  32.14 
 
 
491 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  31.54 
 
 
491 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  32.28 
 
 
491 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  31.58 
 
 
526 aa  183  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  31.75 
 
 
540 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  31.42 
 
 
540 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  29.28 
 
 
536 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  28.88 
 
 
536 aa  171  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  28.49 
 
 
536 aa  171  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  28.34 
 
 
536 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  28.09 
 
 
536 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  28.29 
 
 
536 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  31.42 
 
 
488 aa  167  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  28.69 
 
 
533 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  28.29 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  28.29 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  28.69 
 
 
536 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  32.27 
 
 
505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  30.66 
 
 
475 aa  157  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  31.84 
 
 
574 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  30.69 
 
 
559 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  30.39 
 
 
519 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  28.66 
 
 
542 aa  151  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0436  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.36 
 
 
477 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.194973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  32.09 
 
 
533 aa  150  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.96 
 
 
475 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  29.01 
 
 
544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  30.27 
 
 
536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  27.68 
 
 
506 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.48 
 
 
485 aa  147  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  28.01 
 
 
566 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.69 
 
 
483 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  35.17 
 
 
610 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  30.06 
 
 
520 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  29.56 
 
 
468 aa  143  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.42 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  31.95 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.42 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  29.23 
 
 
496 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  27.38 
 
 
614 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.76 
 
 
486 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  26.64 
 
 
470 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  27.25 
 
 
470 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0402  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.48 
 
 
477 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0325637  hitchhiker  0.0000425632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.83 
 
 
491 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  26.5 
 
 
472 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.11 
 
 
495 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  29.96 
 
 
461 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.61 
 
 
486 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.36 
 
 
479 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.45 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  28.8 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  27.92 
 
 
581 aa  134  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  28.08 
 
 
527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  29.8 
 
 
528 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  29.8 
 
 
528 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.34 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.96 
 
 
486 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  30.06 
 
 
528 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  30.06 
 
 
528 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  30.06 
 
 
528 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  30.06 
 
 
528 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  26.4 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  29.65 
 
 
463 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  26.4 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  30.23 
 
 
528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.48 
 
 
486 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.48 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  26.4 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0434  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.04 
 
 
475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.99 
 
 
489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.677458 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  26.4 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  26.4 
 
 
467 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  34.93 
 
 
494 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.09 
 
 
485 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  27.45 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  30.12 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  26.2 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  30.6 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.11 
 
 
491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0710  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.13 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 
426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.8 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  32.36 
 
 
607 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.26 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  36.55 
 
 
599 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>