More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06441 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  100 
 
 
323 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  98.76 
 
 
323 aa  650    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  95.67 
 
 
323 aa  630  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  91.3 
 
 
323 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  74.3 
 
 
323 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  73.07 
 
 
323 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  74.61 
 
 
323 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  74.61 
 
 
323 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  73.68 
 
 
323 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  74.61 
 
 
323 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  61.8 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  61.92 
 
 
323 aa  394  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  58.82 
 
 
323 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  61.61 
 
 
323 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  59.63 
 
 
323 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  59.75 
 
 
323 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  58.2 
 
 
323 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  58.2 
 
 
323 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  50 
 
 
311 aa  309  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  44.12 
 
 
325 aa  247  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  41.64 
 
 
332 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  41.59 
 
 
309 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  33.42 
 
 
456 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  37.46 
 
 
465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 
322 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  38.33 
 
 
323 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  40 
 
 
483 aa  192  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  36.93 
 
 
323 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  38.31 
 
 
331 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  38.31 
 
 
331 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  38.31 
 
 
331 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.14 
 
 
320 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  38.31 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.28 
 
 
320 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.64 
 
 
322 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.59 
 
 
322 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.38 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.38 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.59 
 
 
320 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.59 
 
 
320 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.49 
 
 
323 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.82 
 
 
320 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.7 
 
 
320 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.81 
 
 
320 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.07 
 
 
323 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.7 
 
 
320 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.7 
 
 
320 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.55 
 
 
320 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 
322 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.69 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  36.18 
 
 
341 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  35.53 
 
 
322 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.25 
 
 
322 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.93 
 
 
331 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.05 
 
 
320 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  36.24 
 
 
333 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  30.94 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  31.78 
 
 
322 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  36.24 
 
 
323 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  33.65 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.91 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  34.15 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  33.96 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  30.6 
 
 
322 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  31.03 
 
 
322 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  33.13 
 
 
332 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.72 
 
 
324 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  34.25 
 
 
332 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  34.15 
 
 
327 aa  175  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 
349 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 
322 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  37.29 
 
 
331 aa  175  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.79 
 
 
321 aa  175  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 
322 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  34.15 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  34.72 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  34.6 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.23 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.09 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.55 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  34.56 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  36.61 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  37.79 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 
318 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  34.35 
 
 
326 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  36.11 
 
 
322 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  33.91 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  33.45 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  33.45 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  33.45 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  33.45 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>