More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1863 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  100 
 
 
389 aa  785    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  49.5 
 
 
202 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  46.03 
 
 
190 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  46.15 
 
 
195 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  44.68 
 
 
367 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0068  adenylate kinase  44.68 
 
 
200 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  42.55 
 
 
374 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  45.16 
 
 
194 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  45.6 
 
 
188 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  41.71 
 
 
189 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  42.02 
 
 
190 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  45.45 
 
 
182 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  37.39 
 
 
309 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  41.18 
 
 
193 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  40.66 
 
 
187 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  41.71 
 
 
195 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  39.78 
 
 
187 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  40.66 
 
 
187 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  39.25 
 
 
189 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  39.89 
 
 
192 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  40.31 
 
 
200 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  42.78 
 
 
200 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  40.31 
 
 
200 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  39.89 
 
 
192 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  39.58 
 
 
200 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  40.86 
 
 
205 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  40.45 
 
 
189 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  40.72 
 
 
341 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  39.69 
 
 
360 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  39.58 
 
 
204 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  40.1 
 
 
193 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  40.1 
 
 
193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  39.04 
 
 
195 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  39.58 
 
 
194 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  40.11 
 
 
181 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  41.21 
 
 
201 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1110  adenylate kinase  42.46 
 
 
182 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  43.41 
 
 
184 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  38.74 
 
 
199 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  42.25 
 
 
183 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19841  adenylate kinase  42.46 
 
 
182 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.966566  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  36.15 
 
 
215 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  40.41 
 
 
193 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  41.18 
 
 
183 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  43.17 
 
 
195 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  42.05 
 
 
182 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  35.58 
 
 
213 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  40.11 
 
 
197 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  43.02 
 
 
191 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  38.67 
 
 
191 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  39.58 
 
 
192 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  38.22 
 
 
206 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  37.21 
 
 
216 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  40.43 
 
 
367 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0311  adenylate kinase  36.41 
 
 
217 aa  142  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173731  unclonable  2.3199200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  38.97 
 
 
205 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  37.84 
 
 
187 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  37.32 
 
 
214 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  37.5 
 
 
214 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_437  adenylate kinase  37.21 
 
 
216 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000304823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0495  adenylate kinase  37.21 
 
 
216 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125231  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  40.91 
 
 
186 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65737  Adenylate kinase (ATP-AMP transphosphorylase)  37.32 
 
 
249 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  35.68 
 
 
215 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  38.74 
 
 
199 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  35.68 
 
 
215 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  38.02 
 
 
192 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  39.27 
 
 
194 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  37.77 
 
 
184 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  36.84 
 
 
215 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  39.27 
 
 
194 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  40.11 
 
 
185 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  39.36 
 
 
191 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  39.27 
 
 
194 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  38.28 
 
 
224 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  41.21 
 
 
183 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  37.77 
 
 
192 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0472  adenylate kinase  36.28 
 
 
216 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00114674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  34.93 
 
 
227 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  35.92 
 
 
217 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  33.49 
 
 
215 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03420  adenylate kinase, putative  35.51 
 
 
269 aa  137  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  36.68 
 
 
205 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  37.23 
 
 
184 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  41.11 
 
 
181 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  35.68 
 
 
224 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  36.6 
 
 
199 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  41.24 
 
 
187 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  38.74 
 
 
192 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  34.78 
 
 
215 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  32.71 
 
 
217 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  39.23 
 
 
194 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  38.34 
 
 
191 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0230  adenylate kinase  39.89 
 
 
187 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.131305  normal  0.147853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1557  adenylate kinase  36.11 
 
 
218 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000621346  normal  0.163414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  38.14 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  39.89 
 
 
195 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1739  adenylate kinases  36.11 
 
 
218 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000022686  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0233  adenylate kinase  38.92 
 
 
187 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  36.32 
 
 
220 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>