More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1453 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1453  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  44.23 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.77 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  42.05 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  43 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.82 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40.2 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  37.7 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  39.78 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  33.05 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  33.33 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  27.97 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.89 
 
 
390 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  35.14 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  38.75 
 
 
123 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  36.56 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  38.89 
 
 
390 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  26.4 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.96 
 
 
390 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
247 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.1 
 
 
378 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  29.63 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.2 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  26.02 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  26.02 
 
 
144 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  26.02 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.96 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
108 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.04 
 
 
387 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  34.02 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
224 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  36.14 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  36.14 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  36.14 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  36.14 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  34.38 
 
 
127 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  36.14 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  36.14 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  27.69 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  36.14 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 
220 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  40.86 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  38.78 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  28.8 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 
127 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  25.6 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.29 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  25.2 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  40 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.56 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  30.84 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  37.89 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  30.84 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  26.21 
 
 
207 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  25.42 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>