230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0501 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  594  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.01 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  40.41 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  38.6 
 
 
259 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  33.99 
 
 
274 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  35.34 
 
 
264 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  36.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  37.82 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  37.54 
 
 
259 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  38.97 
 
 
258 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  39.45 
 
 
261 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  37.45 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.13 
 
 
295 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.14 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  34.06 
 
 
260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  34.78 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  39.16 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  39.16 
 
 
299 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  34.05 
 
 
291 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.83 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  33.81 
 
 
270 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  33.64 
 
 
320 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.69 
 
 
269 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  31.31 
 
 
289 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  37.46 
 
 
274 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  37.92 
 
 
252 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  33.57 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  32.34 
 
 
281 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  31.56 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1841  peptidase A24A domain protein  29.17 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.56 
 
 
329 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  31.65 
 
 
260 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.76 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0682  peptidase A24A domain-containing protein  41.4 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301277  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  37.86 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  34.78 
 
 
257 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  31.07 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.25 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  28.94 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1503  peptidase A24A domain protein  52.34 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0203162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  33.93 
 
 
250 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  32.93 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  30.75 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.02 
 
 
261 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.55 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  30.65 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  30.65 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.73 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  32.73 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.55 
 
 
287 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  32.11 
 
 
288 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  32.73 
 
 
304 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  31.17 
 
 
300 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  34.21 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  36.52 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  31.74 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  34.77 
 
 
283 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  33.01 
 
 
273 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.67 
 
 
288 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.3 
 
 
297 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  33.97 
 
 
296 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  31.13 
 
 
283 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  30.03 
 
 
304 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.6 
 
 
285 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  33.62 
 
 
265 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  31.84 
 
 
283 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  32.86 
 
 
270 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  32.86 
 
 
270 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  37.39 
 
 
269 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  37.02 
 
 
269 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  31.13 
 
 
287 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  36.23 
 
 
275 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  35.85 
 
 
248 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  28.96 
 
 
277 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  32.62 
 
 
254 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.89 
 
 
293 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  29.25 
 
 
301 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  29.72 
 
 
304 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  36.52 
 
 
269 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  32.98 
 
 
250 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  50 
 
 
372 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  31.23 
 
 
283 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  36.97 
 
 
293 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  36.52 
 
 
269 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  37.02 
 
 
269 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  33.09 
 
 
300 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  37.02 
 
 
269 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  28.91 
 
 
280 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  31.97 
 
 
246 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  31.76 
 
 
289 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  32.18 
 
 
287 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  28.4 
 
 
308 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  29.58 
 
 
282 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  38.92 
 
 
262 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.75 
 
 
308 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  31.15 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  31.1 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  32.2 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  32.2 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>