220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1841 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1841  peptidase A24A domain protein  100 
 
 
434 aa  860    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  31.01 
 
 
274 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.28 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.15 
 
 
259 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  26.17 
 
 
263 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  26.79 
 
 
264 aa  123  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  29.23 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  29.17 
 
 
304 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.52 
 
 
266 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.52 
 
 
266 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  28.06 
 
 
273 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.68 
 
 
329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  29.2 
 
 
293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  28.41 
 
 
260 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.33 
 
 
269 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.92 
 
 
259 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  27.08 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  27.08 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  29.27 
 
 
255 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  31.8 
 
 
320 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  28.39 
 
 
263 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  26.67 
 
 
254 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  28.25 
 
 
293 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.31 
 
 
273 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  28.92 
 
 
258 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  26.32 
 
 
259 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  28.53 
 
 
291 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  28.33 
 
 
295 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.15 
 
 
280 aa  103  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  26.17 
 
 
267 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  33.33 
 
 
294 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  26.42 
 
 
247 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  26.91 
 
 
289 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  25.34 
 
 
308 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  25.34 
 
 
308 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  26.1 
 
 
247 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.04 
 
 
281 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  26.3 
 
 
289 aa  99.8  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  39.38 
 
 
275 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  28.29 
 
 
239 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  29.68 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  25.69 
 
 
304 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  25.93 
 
 
265 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  25.14 
 
 
304 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  27.43 
 
 
270 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.05 
 
 
293 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  27.45 
 
 
283 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  27.22 
 
 
301 aa  97.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  43.48 
 
 
252 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  27.94 
 
 
296 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.07 
 
 
308 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  26.36 
 
 
303 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  28.03 
 
 
278 aa  94.4  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  27.44 
 
 
250 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  27.06 
 
 
291 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  27.36 
 
 
253 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.66 
 
 
288 aa  92.8  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  25.63 
 
 
300 aa  93.2  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.62 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  27.51 
 
 
283 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.35 
 
 
265 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  28.45 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  26.91 
 
 
288 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  50.57 
 
 
261 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.07 
 
 
308 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.62 
 
 
308 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  48.89 
 
 
299 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  25.14 
 
 
308 aa  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  54.32 
 
 
262 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  36.53 
 
 
261 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  28.96 
 
 
290 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  26.17 
 
 
297 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  28.07 
 
 
281 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  49.46 
 
 
263 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  50 
 
 
274 aa  86.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  38.89 
 
 
246 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  26.24 
 
 
288 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  27.56 
 
 
290 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  26.11 
 
 
293 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  29.17 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  47.31 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.11 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  25.95 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  36.31 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  26.05 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  26.22 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45.98 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  27.03 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  26.22 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  30.21 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.22 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  47.13 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  31.67 
 
 
295 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  25.5 
 
 
303 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  39.39 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0682  peptidase A24A domain-containing protein  40.98 
 
 
290 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301277  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  34.62 
 
 
240 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  26.5 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  31.21 
 
 
251 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  35.9 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>