191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0249 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  38.81 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  33.85 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  33.93 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  29.6 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  30.7 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  32.46 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  32.08 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  32.08 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  37.5 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  37.21 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  26.02 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  33.04 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  34.96 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  30.65 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  34.09 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  33.86 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  33.33 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  26.09 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  29.92 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  29.69 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  32.54 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  32.86 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  32.86 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  24.39 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  36.8 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  36.44 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  36.51 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  35.71 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  36.51 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  33.1 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  31.45 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  33.33 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  33.9 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  29.84 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  27.91 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  30.89 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  40.38 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  23.39 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  38.64 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  33.07 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  31.3 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  29.51 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  32.73 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  31.16 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  29.57 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  29.03 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  31.3 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  33.91 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  34.82 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  28.68 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  35.34 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  33.86 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  36.89 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  28.69 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  31.03 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  31.2 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  35.59 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  29.51 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  35.4 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  25.2 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  28.57 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  34.48 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  28.57 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  29.66 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  35.38 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  31.34 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  36.73 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  32.09 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  27.68 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  29.73 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  32.09 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  29.13 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  31.9 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  32.65 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  31.2 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  35.85 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  31.9 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  36.09 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  23.57 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  29.79 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  30.47 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  28.81 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  25.64 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  28.23 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  30.47 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>