More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_46542 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  100 
 
 
545 aa  1108    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  43.74 
 
 
606 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  42.13 
 
 
474 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  38.7 
 
 
567 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43135  predicted protein  42.23 
 
 
587 aa  299  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00220  RNA helicase, putative  37.44 
 
 
710 aa  276  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.063496  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24935  helicase_1  43.56 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00894  DEAD box RNA helicase HelA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15620)  32.9 
 
 
641 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.859671  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  36.26 
 
 
609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  38.96 
 
 
567 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.84 
 
 
550 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 
607 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.56 
 
 
522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  37.11 
 
 
481 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.46 
 
 
515 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
526 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
480 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
525 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
525 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  36.59 
 
 
477 aa  230  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
479 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  36.05 
 
 
484 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  36.74 
 
 
495 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 
486 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  35.97 
 
 
520 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  35.79 
 
 
486 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 
520 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 
520 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 
486 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  35.71 
 
 
527 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  37.13 
 
 
589 aa  225  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 
509 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  35.38 
 
 
543 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.77 
 
 
527 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  37.21 
 
 
812 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.91 
 
 
485 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.13 
 
 
515 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.25 
 
 
482 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  31.81 
 
 
765 aa  225  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.9 
 
 
535 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  35.69 
 
 
527 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.75 
 
 
497 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.94 
 
 
452 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.19 
 
 
571 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  35.99 
 
 
491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.91 
 
 
485 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.91 
 
 
485 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  34.91 
 
 
485 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.91 
 
 
485 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.26 
 
 
480 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1851  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.41 
 
 
417 aa  223  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.39 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.46 
 
 
476 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.41 
 
 
482 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.42 
 
 
496 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  34.21 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.27 
 
 
497 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.27 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.29 
 
 
480 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.03 
 
 
643 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.19 
 
 
578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.22 
 
 
489 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.25 
 
 
545 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  35.92 
 
 
559 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  35.75 
 
 
429 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.92 
 
 
549 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.92 
 
 
549 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  35.92 
 
 
481 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.92 
 
 
482 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  35.92 
 
 
482 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 
473 aa  220  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  35.92 
 
 
482 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  35.92 
 
 
482 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.92 
 
 
482 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.6 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  35.75 
 
 
799 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  35.03 
 
 
473 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.04 
 
 
439 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.52 
 
 
466 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
628 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.77 
 
 
515 aa  219  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.77 
 
 
515 aa  219  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.33 
 
 
443 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.97 
 
 
560 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.23 
 
 
506 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.72 
 
 
488 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.67 
 
 
504 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.66 
 
 
477 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.22 
 
 
418 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.22 
 
 
418 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.79 
 
 
522 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.31 
 
 
479 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.67 
 
 
511 aa  217  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.72 
 
 
565 aa  217  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.75 
 
 
626 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0927  DEAD/DEAH box helicase-like  38.73 
 
 
445 aa  217  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  35.86 
 
 
460 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.29 
 
 
448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.85 
 
 
487 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.11 
 
 
471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>