More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0226 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0226  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 362 aa  745    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0485  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00291499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  35.93 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  36.66 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  36.54 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  35.2 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  34.71 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  29.56 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0301  regulatory protein GntR HTH  30.47 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.814124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0649  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.92 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.174613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  29.16 
 
 		 368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  25.27 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1774  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.472871  normal  0.0293451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  25.95 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  27.93 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  29.72 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.86 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.86 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.86 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.41 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  26.53 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  26.07 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  26.46 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  25.39 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.53 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  29.72 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  29.37 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4106  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.37 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  hitchhiker  0.000026097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.72 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  24.34 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.72 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.72 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.72 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.37 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  25.92 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  29.72 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.45 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.03 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  27.36 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.03 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  27.1 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  28.28 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  26.89 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.24 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  26.53 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  28.47 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3226  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.32 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  27.24 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  28.37 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4590  LacI family transcription regulator  26.19 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3178  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.32 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.47 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3241  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.32 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3160  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.32 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  25.22 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  28.47 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  25.52 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  23.55 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  24.85 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3704  transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  24.1 
 
 		 335 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  26.95 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 533 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.09 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  27.43 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3342  DNA-binding transcriptional regulator GalR  27.97 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0205886 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.08 
 
 		 337 aa  106  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3278  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.72 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  26.48 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.98 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  23.62 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  27.42 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.58 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  24.01 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  27.42 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  25.18 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  25.4 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.93 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  26.13 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  24.41 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  28.37 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1599  LacI family transcription regulator  24.12 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  27.03 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  26.86 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  23.49 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  25.67 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  25.7 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5410  LacI family transcription regulator  25.35 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  26.74 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>