50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2629 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  100 
 
 
687 aa  1361    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  55.38 
 
 
692 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  52.52 
 
 
696 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  54.28 
 
 
699 aa  715    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  50 
 
 
689 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  80.93 
 
 
687 aa  1078    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  52.23 
 
 
696 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  51.39 
 
 
731 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  53.2 
 
 
692 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  52.53 
 
 
693 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  52.09 
 
 
696 aa  673    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  63.77 
 
 
688 aa  831    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  50.29 
 
 
691 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  50.72 
 
 
689 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  80.49 
 
 
687 aa  1093    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  50.72 
 
 
691 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  81.95 
 
 
687 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  81.8 
 
 
687 aa  1085    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  82.24 
 
 
687 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  53.82 
 
 
690 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  90.39 
 
 
687 aa  1159    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  49.2 
 
 
689 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  50.14 
 
 
691 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  52.5 
 
 
689 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  51.14 
 
 
689 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  46.22 
 
 
688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  44.98 
 
 
694 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  45.93 
 
 
687 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  44.89 
 
 
688 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  42.25 
 
 
696 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  46.89 
 
 
724 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  44.76 
 
 
680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  40.09 
 
 
695 aa  501  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  44.32 
 
 
690 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  42.22 
 
 
715 aa  463  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  43.41 
 
 
700 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  36.26 
 
 
670 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  31.18 
 
 
761 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  31.18 
 
 
761 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  30.75 
 
 
761 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  30 
 
 
759 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  27.19 
 
 
838 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.58 
 
 
829 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  23.76 
 
 
677 aa  58.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  25.34 
 
 
705 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  28.1 
 
 
796 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  22.6 
 
 
690 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  20.92 
 
 
732 aa  47.4  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  23.53 
 
 
690 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  26.5 
 
 
878 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>