76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2165 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  84.94 
 
 		 312 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  63.16 
 
 		 325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  66.47 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  61.61 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  60 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  58.75 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  53.06 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.55 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.49 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.49 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.54 
 
 		 318 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.95 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.44 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  66.92 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.64 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.24 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  63.91 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  43.19 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  40 
 
 		 342 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.12 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.39 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.1 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  32.02 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.85 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.24 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.21 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.02 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.32 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.37 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.07 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.17 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.53 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.5 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  27.38 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.21 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.75 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  26.42 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  28.11 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  27.51 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  28.11 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  28.11 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  28.11 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  27.81 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.83 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.33 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.69 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  27.73 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  28.85 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  26.33 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.69 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.38 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.69 
 
 		 343 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.69 
 
 		 343 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.62 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.85 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.07 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  24.92 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  26.67 
 
 		 281 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.83 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.33 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  28.71 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.48 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.08 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  24.62 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.89 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.65 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.77 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.34 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.39 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.3 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  27.11 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  29.41 
 
 		 356 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  25.89 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.09 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5777  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.91 
 
 		 448 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>