124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1680 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  80.25 
 
 
319 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  62.33 
 
 
320 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  61.13 
 
 
309 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  56.19 
 
 
309 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  59.22 
 
 
308 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  53.65 
 
 
312 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  41.2 
 
 
303 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  32.74 
 
 
315 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  32.28 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  28.01 
 
 
312 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  30.18 
 
 
319 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  29.05 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.75 
 
 
318 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  26.42 
 
 
325 aa  123  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  25.42 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  25 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  26.07 
 
 
315 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  25 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  25.64 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  26.09 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  26.21 
 
 
443 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  24.91 
 
 
452 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.9 
 
 
435 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  24.1 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.22 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.01 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.53 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.51 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.2 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.71 
 
 
442 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  19.4 
 
 
430 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.74 
 
 
482 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.42 
 
 
430 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.02 
 
 
430 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  22.26 
 
 
434 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.64 
 
 
430 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  29.56 
 
 
465 aa  62.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.1 
 
 
434 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.87 
 
 
498 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.07 
 
 
424 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.3 
 
 
442 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  25.34 
 
 
475 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.58 
 
 
456 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.33 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  23.61 
 
 
271 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  25.19 
 
 
399 aa  59.3  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.29 
 
 
434 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.29 
 
 
434 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.29 
 
 
434 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.39 
 
 
476 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.83 
 
 
434 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  21.83 
 
 
434 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  21.83 
 
 
434 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  21.83 
 
 
434 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  22.77 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.43 
 
 
434 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  22.44 
 
 
271 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.09 
 
 
434 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000138448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.41 
 
 
471 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  20 
 
 
441 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.38 
 
 
430 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  22.74 
 
 
471 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  24.55 
 
 
469 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.46 
 
 
454 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  19.48 
 
 
439 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.46 
 
 
452 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  19.48 
 
 
439 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  19.28 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.42 
 
 
446 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4481  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.51 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  20.51 
 
 
441 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  20.6 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.67 
 
 
444 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.79 
 
 
437 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.78 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  21.98 
 
 
438 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  20.6 
 
 
477 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.31 
 
 
432 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.38 
 
 
426 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  23.32 
 
 
500 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  21.94 
 
 
320 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.03 
 
 
452 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  23.32 
 
 
500 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.03 
 
 
452 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  22.03 
 
 
452 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  22.41 
 
 
275 aa  49.3  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  21.58 
 
 
443 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.46 
 
 
431 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.56 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  18.1 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  20.34 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  18.1 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  18.1 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  20.95 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0210  SurA domain-containing protein  24.62 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  21.43 
 
 
451 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  22.03 
 
 
453 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0794  hypothetical protein  22.29 
 
 
399 aa  47  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>