57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2835 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  100 
 
 
303 aa  620  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  40.39 
 
 
314 aa  220  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  39.29 
 
 
319 aa  215  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  37.29 
 
 
320 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  38.08 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  37.59 
 
 
308 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  35.23 
 
 
309 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  34.2 
 
 
309 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  32.73 
 
 
306 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  32.53 
 
 
312 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  30.72 
 
 
314 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  31.53 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  30.45 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.45 
 
 
318 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  31.45 
 
 
318 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  29.82 
 
 
315 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  28.68 
 
 
325 aa  108  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  27.87 
 
 
315 aa  99.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.09 
 
 
423 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  30.67 
 
 
398 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  26.25 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.4 
 
 
424 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  22.66 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.46 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.19 
 
 
444 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.9 
 
 
446 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28 
 
 
471 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  22.8 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.78 
 
 
446 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  27.43 
 
 
471 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  27.71 
 
 
475 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.55 
 
 
476 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  29.77 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.52 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4481  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.62 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.86 
 
 
454 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.25 
 
 
442 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  26.92 
 
 
464 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.47 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.31 
 
 
405 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  26.52 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  24.33 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  20.54 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  24.29 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.96 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.95 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  22.48 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  21.91 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  21.17 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  31.34 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0794  hypothetical protein  24.62 
 
 
399 aa  43.5  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  23.46 
 
 
475 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.44 
 
 
427 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.96 
 
 
435 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  21.82 
 
 
271 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>