More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0410 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
446 aa  900    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  60.24 
 
 
456 aa  488  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.05 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  35.22 
 
 
443 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.92 
 
 
444 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  28.83 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.68 
 
 
435 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.86 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.78 
 
 
452 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.1 
 
 
426 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.11 
 
 
435 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  29.02 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  28.36 
 
 
439 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.85 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  28.29 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  28.78 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.47 
 
 
428 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.23 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1655  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.06 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.35 
 
 
426 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  25.91 
 
 
453 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.03 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.72 
 
 
432 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.74 
 
 
437 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.03 
 
 
430 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.55 
 
 
447 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.19 
 
 
498 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.97 
 
 
453 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  25.42 
 
 
451 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.37 
 
 
452 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.19 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  25.37 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.55 
 
 
349 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.88 
 
 
452 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  24.88 
 
 
452 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.88 
 
 
452 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  24.76 
 
 
463 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  25.31 
 
 
430 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  29.13 
 
 
477 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.21 
 
 
423 aa  97.8  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  29.13 
 
 
436 aa  97.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.24 
 
 
454 aa  97.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.76 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.82 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.84 
 
 
476 aa  93.6  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.32 
 
 
440 aa  94  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.67 
 
 
436 aa  90.9  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  27.53 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.8 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  24.22 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  23.8 
 
 
450 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.6 
 
 
326 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  23.8 
 
 
450 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.27 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  23.91 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  23.91 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  28.1 
 
 
311 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  23.91 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  23.91 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  24.82 
 
 
475 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  30.12 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  24.51 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.51 
 
 
435 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  22.14 
 
 
399 aa  87.4  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  25.31 
 
 
321 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.87 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.9 
 
 
321 aa  86.7  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.63 
 
 
430 aa  86.7  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  26.65 
 
 
500 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  22.33 
 
 
429 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  22.33 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.57 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  26.54 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.94 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.32 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.34 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.58 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.69 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.3 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  23.82 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.81 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.62 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4075  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.53 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  27.68 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.09 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.51 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  24.69 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.45 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.45 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  26.97 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2988  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.9 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0133874  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.2 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.66 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.78 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  26.24 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.71 
 
 
433 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.13 
 
 
427 aa  77  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  23.43 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.05 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.632638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>