More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2011 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  69.03 
 
 
463 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
468 aa  954    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  97.86 
 
 
463 aa  927    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  66 
 
 
447 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.82 
 
 
426 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  39.31 
 
 
438 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  37.95 
 
 
454 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  39.02 
 
 
428 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.54 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  42.82 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  36.53 
 
 
430 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  37.32 
 
 
441 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.61 
 
 
433 aa  279  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  35.76 
 
 
439 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  35.76 
 
 
439 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.75 
 
 
437 aa  276  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  36.34 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  37.41 
 
 
475 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.53 
 
 
427 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.32 
 
 
426 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.95 
 
 
430 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.05 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.39 
 
 
435 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  36.03 
 
 
430 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  35.78 
 
 
430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  34.19 
 
 
429 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.75 
 
 
438 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.62 
 
 
433 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  34.31 
 
 
429 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.54 
 
 
432 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.16 
 
 
432 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.79 
 
 
430 aa  256  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.9 
 
 
471 aa  256  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.08 
 
 
473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  34.39 
 
 
434 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  34.23 
 
 
434 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.23 
 
 
434 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  34.23 
 
 
434 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  34.23 
 
 
434 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  37.16 
 
 
471 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.47 
 
 
434 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.76 
 
 
436 aa  249  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  33.96 
 
 
434 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.66 
 
 
434 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.66 
 
 
434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 
447 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.66 
 
 
434 aa  246  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.69 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2886  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.58 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000330996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0097  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.95 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0531154  normal  0.145307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0101  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.95 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.002065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.95 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.308469  normal  0.913442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3077  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.41 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.95 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.632638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.74 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000138448  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.95 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.69 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4075  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.58 
 
 
469 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.71 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  33.03 
 
 
427 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.92 
 
 
431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1016  SurA domain-containing protein  32.95 
 
 
434 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000539949  hitchhiker  0.00270369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  35.71 
 
 
475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.12 
 
 
434 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.12 
 
 
434 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.12 
 
 
434 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.88 
 
 
427 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  32.73 
 
 
427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0864  SurA domain-containing protein  30.98 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  34.01 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.56 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.01 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  34.01 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  34.01 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  34.01 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  34.01 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  33.1 
 
 
465 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  34.01 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.08 
 
 
493 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.18 
 
 
428 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  33.56 
 
 
448 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  32.18 
 
 
428 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  32.18 
 
 
428 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.18 
 
 
428 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  32.49 
 
 
431 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.18 
 
 
428 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.18 
 
 
428 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  32.18 
 
 
428 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.18 
 
 
428 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.87 
 
 
428 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00440274  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.25 
 
 
433 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  34.39 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  32.85 
 
 
463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.56 
 
 
453 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  33.02 
 
 
453 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.14 
 
 
476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1655  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.2 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.17 
 
 
452 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  33.17 
 
 
452 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.17 
 
 
452 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>