More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1707 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
316 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.89 
 
 
321 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.32 
 
 
317 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33 
 
 
317 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.18 
 
 
333 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  33.55 
 
 
321 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.33 
 
 
345 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4471  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.43 
 
 
336 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4335  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.1 
 
 
338 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4490  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.1 
 
 
338 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.69 
 
 
355 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  30.87 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.48 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4481  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.23 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.18 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  29.04 
 
 
320 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  29.67 
 
 
316 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.3 
 
 
433 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  29.9 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.34 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4225  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.67 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350746  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  29.81 
 
 
438 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  31 
 
 
447 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1655  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.18 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.33 
 
 
343 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  26.77 
 
 
332 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  24.52 
 
 
321 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.56 
 
 
463 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.23 
 
 
440 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.19 
 
 
321 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2605  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.39 
 
 
326 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.02 
 
 
437 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.11 
 
 
317 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  24.72 
 
 
431 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  26.72 
 
 
477 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2740  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.51 
 
 
335 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000934934  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  26.72 
 
 
436 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.99 
 
 
433 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.41 
 
 
447 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  25.79 
 
 
465 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.19 
 
 
426 aa  99.8  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  30.23 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  25.1 
 
 
453 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  25.1 
 
 
429 aa  99.4  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  24.71 
 
 
429 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.46 
 
 
493 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.81 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.36 
 
 
499 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  26.13 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.15 
 
 
453 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.08 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2988  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.28 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0133874  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.4 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.78 
 
 
436 aa  95.9  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.85 
 
 
431 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  29.15 
 
 
500 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  29 
 
 
500 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.16 
 
 
427 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  25 
 
 
448 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  25 
 
 
450 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1980  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.17 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  25 
 
 
450 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  25 
 
 
448 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  25 
 
 
448 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  25 
 
 
448 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
448 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.62 
 
 
468 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  25 
 
 
448 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  26.62 
 
 
463 aa  92.8  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.71 
 
 
435 aa  92.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  24.61 
 
 
452 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.61 
 
 
452 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.62 
 
 
454 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.22 
 
 
452 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.28 
 
 
442 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28 
 
 
438 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  23.83 
 
 
452 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.83 
 
 
452 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.83 
 
 
452 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.11 
 
 
428 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0015  SurA domain  29.43 
 
 
438 aa  89.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00201021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.59 
 
 
442 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  24.22 
 
 
451 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0370  chaperone SurA precursor  22.05 
 
 
436 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.55 
 
 
416 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.31 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  24.21 
 
 
434 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.45 
 
 
427 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.2 
 
 
430 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  24.71 
 
 
434 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  26.49 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  25.19 
 
 
430 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  27.51 
 
 
463 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  25.66 
 
 
427 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1416  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.08 
 
 
352 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.146032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.81 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.33 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.3 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.14 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  22.3 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>