More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3341 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  895    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  34.92 
 
 
452 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.22 
 
 
446 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.15 
 
 
444 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.39 
 
 
446 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.52 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.1 
 
 
435 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.86 
 
 
427 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.96 
 
 
452 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.58 
 
 
430 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.78 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.85 
 
 
426 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.5 
 
 
442 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.16 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.06 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  28.78 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  28.81 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  28.29 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.71 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.48 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  27.65 
 
 
439 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  26.97 
 
 
475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.09 
 
 
430 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  27.32 
 
 
441 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  27.75 
 
 
441 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.4 
 
 
435 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30 
 
 
498 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  27.56 
 
 
452 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  28.46 
 
 
453 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.32 
 
 
452 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  27.5 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.8 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.8 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  27.8 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.88 
 
 
440 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.32 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  29.25 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  25.99 
 
 
429 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.07 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  25.6 
 
 
429 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  29.01 
 
 
500 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.23 
 
 
426 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.65 
 
 
433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.69 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.94 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  28.61 
 
 
436 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  28.61 
 
 
477 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  27.54 
 
 
463 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  25.92 
 
 
465 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.12 
 
 
448 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  27.12 
 
 
450 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  27.12 
 
 
450 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.92 
 
 
432 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  27.12 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  27.12 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  27.12 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.09 
 
 
463 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  27.12 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.7 
 
 
493 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.67 
 
 
471 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.21 
 
 
423 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.07 
 
 
428 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00440274  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  26.79 
 
 
448 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.81 
 
 
447 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.57 
 
 
454 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.38 
 
 
433 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.9 
 
 
499 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.67 
 
 
427 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  26.43 
 
 
471 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  22.33 
 
 
427 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.78 
 
 
431 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.78 
 
 
431 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1655  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.37 
 
 
451 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.48 
 
 
436 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.68 
 
 
428 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.632638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.68 
 
 
428 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.308469  normal  0.913442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.68 
 
 
428 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0101  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.68 
 
 
428 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.002065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0097  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.68 
 
 
428 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0531154  normal  0.145307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.53 
 
 
317 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4075  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.57 
 
 
469 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.8 
 
 
434 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.8 
 
 
434 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.5 
 
 
432 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.04 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.27 
 
 
438 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  24.29 
 
 
430 aa  97.8  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.74 
 
 
317 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.38 
 
 
428 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  23.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  23.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.43 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  23.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  22.92 
 
 
399 aa  94.4  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.77 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  25.75 
 
 
463 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>