139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1811 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  843    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  40.94 
 
 
398 aa  246  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.16 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.16 
 
 
435 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.91 
 
 
424 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.96 
 
 
423 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.75 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.47 
 
 
444 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.44 
 
 
446 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.95 
 
 
435 aa  96.3  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.38 
 
 
446 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.3 
 
 
454 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  22.54 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  24.81 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  25.98 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.11 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  26.32 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  24.82 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  26.27 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.49 
 
 
498 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  24.57 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  21.73 
 
 
452 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  29.53 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  26.09 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.34 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.09 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.5 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.95 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  25.96 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.43 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  24.6 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  25.96 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  25.96 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.2 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.07 
 
 
434 aa  67  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.07 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.07 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.92 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  22.6 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.8 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.42 
 
 
452 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  23.29 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.55 
 
 
428 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.35 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  24.14 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.56 
 
 
430 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  28.35 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.99 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  23.06 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.06 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  23.06 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.48 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  23.06 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.58 
 
 
435 aa  61.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.88 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.93 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  24.91 
 
 
441 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.91 
 
 
437 aa  60.1  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.25 
 
 
431 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.83 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.93 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  22.52 
 
 
500 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  23.65 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  25.62 
 
 
314 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.22 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.64 
 
 
303 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.7 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00440274  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  23.91 
 
 
471 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.02 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  27.12 
 
 
318 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.75 
 
 
447 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.34 
 
 
473 aa  57  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  20.95 
 
 
463 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  22.52 
 
 
500 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  24.31 
 
 
312 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  25.81 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  25 
 
 
477 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.46 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  25 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.64 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  22.64 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  22.64 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.64 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.18 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.49 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.55 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  26.62 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.64 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  22.64 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.37 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.64 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.64 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  24.41 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  25.13 
 
 
319 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.94 
 
 
468 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  22.96 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.61 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.71 
 
 
482 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  21.89 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  20.28 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>