More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0888 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
456 aa  919    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  60.24 
 
 
446 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.95 
 
 
446 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.93 
 
 
444 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  31.48 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  30.02 
 
 
452 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.94 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.43 
 
 
427 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.07 
 
 
452 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  28.19 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  30.17 
 
 
471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  27.3 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  27.3 
 
 
439 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  26.17 
 
 
465 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.68 
 
 
471 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  27.34 
 
 
441 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.83 
 
 
437 aa  107  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.62 
 
 
435 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.46 
 
 
426 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.83 
 
 
427 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  27.58 
 
 
451 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.97 
 
 
423 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.67 
 
 
430 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.97 
 
 
452 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  26.15 
 
 
452 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  25.92 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.92 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.88 
 
 
433 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.15 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.92 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.32 
 
 
498 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.29 
 
 
432 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.41 
 
 
430 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.21 
 
 
430 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.87 
 
 
442 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.98 
 
 
426 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  26.49 
 
 
453 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  26.43 
 
 
431 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.87 
 
 
428 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  23.21 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  26.46 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  27.36 
 
 
448 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.38 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  27.36 
 
 
448 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  27.36 
 
 
448 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.36 
 
 
448 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  27.36 
 
 
448 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  27.36 
 
 
450 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  27.36 
 
 
450 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  29.76 
 
 
438 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.92 
 
 
463 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.5 
 
 
427 aa  97.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0370  chaperone SurA precursor  24.88 
 
 
436 aa  97.1  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.68 
 
 
431 aa  96.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.67 
 
 
440 aa  96.7  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  27.12 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.67 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.88 
 
 
349 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.64 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.36 
 
 
453 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  28.83 
 
 
447 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4481  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.46 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  26.34 
 
 
463 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.4 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.8 
 
 
476 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1655  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.72 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  23.66 
 
 
477 aa  90.1  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  28.35 
 
 
311 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.95 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.69 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  25.26 
 
 
321 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.2 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.85 
 
 
473 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  28.8 
 
 
463 aa  87.4  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.17 
 
 
321 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.8 
 
 
326 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  25.49 
 
 
430 aa  87  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  26.65 
 
 
500 aa  87  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4075  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.83 
 
 
469 aa  86.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  27.64 
 
 
429 aa  86.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  26.43 
 
 
500 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.72 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  27.44 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  24.43 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.53 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.07 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.12 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.12 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.13 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0785  hypothetical protein  28.12 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.954902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  28.4 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.29 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  25.42 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.74 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  24.19 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.89 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.53 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  26.22 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4335  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.95 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0015  SurA domain  29.3 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00201021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>