127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1760 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  100 
 
 
312 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  46.28 
 
 
318 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.95 
 
 
318 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  44.9 
 
 
319 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  45.99 
 
 
314 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  46.34 
 
 
314 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  40.79 
 
 
325 aa  255  9e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  45.08 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  40.84 
 
 
315 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  27.91 
 
 
314 aa  142  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.39 
 
 
303 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  30.5 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  26.12 
 
 
309 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  27.56 
 
 
308 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  26.62 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  25.51 
 
 
309 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  24.17 
 
 
320 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  29.54 
 
 
306 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  26.25 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.19 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.19 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  25 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  24.7 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.05 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  24.7 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  24.19 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.1 
 
 
444 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.63 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  22.5 
 
 
430 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.53 
 
 
453 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.08 
 
 
424 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.7 
 
 
446 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.64 
 
 
459 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.71 
 
 
433 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.36 
 
 
438 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.71 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1560  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PPIC-type  22.33 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000278048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.1 
 
 
442 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25.4 
 
 
422 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.08 
 
 
498 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.05 
 
 
430 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.76 
 
 
456 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.68 
 
 
473 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.66 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  20.87 
 
 
429 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.12 
 
 
426 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  23.56 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  20.87 
 
 
429 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0370  chaperone SurA precursor  24.62 
 
 
436 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  27.54 
 
 
434 aa  52.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.36 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  21.53 
 
 
438 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.71 
 
 
427 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.48 
 
 
452 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1016  SurA domain-containing protein  23.08 
 
 
434 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000539949  hitchhiker  0.00270369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  22.92 
 
 
452 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  22.97 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  26.67 
 
 
475 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  22.69 
 
 
434 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0210  SurA domain-containing protein  22.83 
 
 
395 aa  49.7  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.15 
 
 
471 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.13 
 
 
482 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  22.97 
 
 
448 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.97 
 
 
448 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.92 
 
 
452 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  22.97 
 
 
448 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  22.97 
 
 
448 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  22.97 
 
 
450 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  22.97 
 
 
450 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  22.97 
 
 
448 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.37 
 
 
446 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0794  hypothetical protein  19.01 
 
 
399 aa  49.3  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  26.53 
 
 
452 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  26.15 
 
 
471 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  24.84 
 
 
500 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  23.08 
 
 
451 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  24.84 
 
 
500 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  23.17 
 
 
441 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0418  SurA domain  24.06 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.027362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.28 
 
 
430 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 
427 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.73 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.72 
 
 
476 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  21.88 
 
 
427 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  23.55 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.15 
 
 
463 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  22.45 
 
 
443 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  23.75 
 
 
399 aa  47  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.1 
 
 
427 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.93 
 
 
447 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  23.17 
 
 
439 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.31 
 
 
434 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  23.17 
 
 
439 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.37 
 
 
316 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  19.38 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.31 
 
 
434 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.31 
 
 
434 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  22.1 
 
 
320 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>