63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1539 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  64.14 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  63.21 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  61.35 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  45.42 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.1 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  43.79 
 
 		 319 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  45.08 
 
 		 312 aa  254  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  41.52 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  26.49 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  27.82 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.87 
 
 		 303 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  26.52 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  26.67 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  27.33 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  25.58 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  27.4 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  25.36 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  27.7 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.54 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.54 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.09 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  26.07 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.4 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  28.35 
 
 		 422 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  29.41 
 
 		 452 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  24.5 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  25.77 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.51 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.76 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0794  hypothetical protein  24.03 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.73 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.7 
 
 		 444 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  24.17 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.66 
 
 		 437 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.35 
 
 		 438 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.54 
 
 		 446 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  25.33 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  23.75 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.62 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0210  SurA domain-containing protein  23.19 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1573  SurA domain  30.25 
 
 		 482 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  21.7 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  21.7 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  21.7 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.7 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.91 
 
 		 349 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.85 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.93 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.9 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.74 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.5 
 
 		 436 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.01 
 
 		 416 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.42 
 
 		 482 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  21.85 
 
 		 464 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  23.55 
 
 		 438 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.54 
 
 		 427 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  26.6 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2197  hypothetical protein  26.56 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000001715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  27.69 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  23.7 
 
 		 436 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  25.24 
 
 		 469 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>