79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1294 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  38.18 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  38.13 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  37.82 
 
 		 271 aa  202  7e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  36.13 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0243  putative periplasmic protein  34.8 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1563  putative periplasmic protein  29.78 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0019619  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2197  hypothetical protein  29.6 
 
 		 283 aa  141  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000001715  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0110  putative periplasmic protein  30.58 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  27.74 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.64 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.47 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  20.86 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  20.86 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  27.78 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.84 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.87 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  20.86 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.32 
 
 		 432 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.31 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  24.18 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  20.5 
 
 		 441 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  23.2 
 
 		 438 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.76 
 
 		 434 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  23.18 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.76 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.76 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.32 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.38 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.33 
 
 		 431 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  29.05 
 
 		 431 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.24 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.31 
 
 		 430 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.88 
 
 		 428 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0370  chaperone SurA precursor  31.19 
 
 		 436 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  19.46 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  23.77 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.21 
 
 		 468 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  23.12 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.46 
 
 		 437 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  35.21 
 
 		 463 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  32.39 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.65 
 
 		 430 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.3 
 
 		 426 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2886  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 		 434 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000330996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1869  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.53 
 
 		 484 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.588757  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  24.18 
 
 		 443 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 		 426 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.56 
 
 		 436 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  26.37 
 
 		 475 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  17.52 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.95 
 
 		 405 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.75 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  19.74 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  20.15 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  21.26 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.6 
 
 		 440 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.71 
 
 		 444 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  22.7 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.31 
 
 		 435 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.12 
 
 		 493 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.85 
 
 		 471 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.18 
 
 		 482 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.22 
 
 		 416 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.58 
 
 		 434 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  27.69 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  28.57 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>