81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0505 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  100 
 
 
325 aa  670    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  49.52 
 
 
319 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  47.77 
 
 
318 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.77 
 
 
318 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  41.3 
 
 
312 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  41.52 
 
 
315 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  38.93 
 
 
315 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  37.33 
 
 
314 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  37.54 
 
 
314 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  28.39 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  26.28 
 
 
309 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  26.33 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  25.86 
 
 
319 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  26.33 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  25.08 
 
 
312 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  27.89 
 
 
315 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.45 
 
 
303 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  27.05 
 
 
306 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  27.61 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.69 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.43 
 
 
405 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  26.14 
 
 
443 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  22.27 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.94 
 
 
456 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.23 
 
 
435 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.23 
 
 
435 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.74 
 
 
427 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.98 
 
 
435 aa  55.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.13 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1560  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PPIC-type  23.97 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000278048  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1266  hypothetical protein  25.88 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.279475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.59 
 
 
430 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.71 
 
 
452 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.81 
 
 
446 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.49 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.48 
 
 
442 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.04 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  21.22 
 
 
439 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.22 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  24.72 
 
 
429 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25 
 
 
422 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  21.22 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  22.19 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.64 
 
 
428 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.23 
 
 
437 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  24.76 
 
 
441 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.66 
 
 
437 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  23.31 
 
 
500 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  23.31 
 
 
500 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  23.73 
 
 
429 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.64 
 
 
493 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  22.07 
 
 
434 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.55 
 
 
440 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.33 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.27 
 
 
438 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.01 
 
 
446 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.6 
 
 
434 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.6 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.08 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.56 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  23.3 
 
 
464 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.6 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.07 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.6 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  25.29 
 
 
465 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  30 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.71 
 
 
427 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.08 
 
 
433 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0418  SurA domain  27.52 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.027362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.23 
 
 
499 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  20.27 
 
 
434 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  22.86 
 
 
475 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  24.09 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.27 
 
 
432 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  21.22 
 
 
443 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.5 
 
 
317 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  22.82 
 
 
441 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  21.98 
 
 
316 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  21.11 
 
 
447 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  19.84 
 
 
436 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  19.84 
 
 
477 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>