46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1065 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  100 
 
 
314 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  96.18 
 
 
314 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  65.12 
 
 
315 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  64.14 
 
 
315 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  45.99 
 
 
312 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.24 
 
 
318 aa  255  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  44.24 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  43.61 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  36.57 
 
 
325 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.01 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  26.49 
 
 
320 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  25.63 
 
 
309 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  25.49 
 
 
314 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  28.37 
 
 
308 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  25.86 
 
 
309 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  28.3 
 
 
312 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  26.32 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  26.5 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.67 
 
 
423 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.72 
 
 
446 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  25.54 
 
 
452 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  24.7 
 
 
443 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.95 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.43 
 
 
405 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.89 
 
 
435 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.89 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  25 
 
 
430 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.24 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  23.57 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.83 
 
 
422 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  25 
 
 
398 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28 
 
 
427 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.42 
 
 
446 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.62 
 
 
444 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.75 
 
 
424 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0418  SurA domain  27.62 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.027362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  23.68 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.84 
 
 
452 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.95 
 
 
430 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.88 
 
 
442 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  22.63 
 
 
438 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.46 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.59 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  22.32 
 
 
465 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1560  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PPIC-type  21.86 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000278048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>