61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0418 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0418  SurA domain  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.027362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0547  SurA domain protein  28.52 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.888673  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1560  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PPIC-type  28.86 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000278048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.51 
 
 		 459 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  29.41 
 
 		 429 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  32.17 
 
 		 429 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  30.91 
 
 		 469 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  32.26 
 
 		 438 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  36.92 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.57 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00440274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  25.41 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.52 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.52 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.52 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  27.62 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.88 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.9 
 
 		 427 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0370  chaperone SurA precursor  26.03 
 
 		 436 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  28.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26.47 
 
 		 430 aa  49.3  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  36.26 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  21.65 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  22.93 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.37 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.632638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0101  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.37 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.002065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.37 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.308469  normal  0.913442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.37 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0097  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.37 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0531154  normal  0.145307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  29.89 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27 
 
 		 431 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.37 
 
 		 434 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000138448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.2 
 
 		 433 aa  46.2  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.83 
 
 		 434 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  23.25 
 
 		 434 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  32.31 
 
 		 431 aa  45.8  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.22 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  24.87 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.19 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.82 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.13 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3077  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.47 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0955  SurA domain protein  28.44 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  27.27 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0565  peptidylprolyl cis-trans isomerase SurA  28.47 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.306851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2886  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.34 
 
 		 434 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000330996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  26 
 
 		 431 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  27.52 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1016  SurA domain-containing protein  30.85 
 
 		 434 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000539949  hitchhiker  0.00270369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.53 
 
 		 434 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1049  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.54 
 
 		 439 aa  42.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>