More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2141 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 
624 aa  1290    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.57 
 
 
607 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.28 
 
 
605 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  40.06 
 
 
626 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  38.47 
 
 
595 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  38.47 
 
 
595 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  40.98 
 
 
598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  38.78 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  37.19 
 
 
601 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.2 
 
 
610 aa  326  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.67 
 
 
593 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.71 
 
 
610 aa  294  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.03 
 
 
597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.65 
 
 
597 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 
590 aa  279  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.17 
 
 
618 aa  270  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  30.21 
 
 
601 aa  261  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.08 
 
 
597 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.53 
 
 
586 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  30.86 
 
 
590 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  40.06 
 
 
615 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.92 
 
 
594 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.52 
 
 
604 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  38.43 
 
 
243 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.8 
 
 
558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.31 
 
 
536 aa  135  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.31 
 
 
536 aa  135  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  57.14 
 
 
112 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  29.97 
 
 
538 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.5 
 
 
438 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  26.41 
 
 
521 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.08 
 
 
555 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  27.15 
 
 
521 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.49 
 
 
554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  30.65 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.84 
 
 
437 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.35 
 
 
450 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  31.89 
 
 
846 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.65 
 
 
423 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  31.5 
 
 
846 aa  104  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  34.83 
 
 
1085 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.97 
 
 
442 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  30.45 
 
 
968 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  23.02 
 
 
848 aa  101  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  33.83 
 
 
1088 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.92 
 
 
445 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  25.05 
 
 
871 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 
903 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  27.99 
 
 
956 aa  98.6  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 
900 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  30.93 
 
 
882 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  30.33 
 
 
881 aa  97.8  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  32.83 
 
 
867 aa  97.4  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  31.91 
 
 
857 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  33.86 
 
 
864 aa  96.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.41 
 
 
443 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  34.98 
 
 
896 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  30.38 
 
 
862 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  31.91 
 
 
857 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  30.29 
 
 
930 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  30.62 
 
 
903 aa  95.1  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 
889 aa  95.1  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  27.38 
 
 
840 aa  94.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  31.49 
 
 
855 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 
874 aa  94.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  34.04 
 
 
905 aa  94.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  31.49 
 
 
859 aa  94  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  30.41 
 
 
855 aa  94  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  25.1 
 
 
895 aa  94  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
904 aa  93.6  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
892 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
892 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
890 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
894 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
892 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  27.64 
 
 
892 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
892 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
892 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
892 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  31.34 
 
 
857 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
890 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  31.8 
 
 
880 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 
860 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 
895 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  30.49 
 
 
860 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  30.89 
 
 
891 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 
881 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  31.23 
 
 
910 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  31.23 
 
 
910 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  23.58 
 
 
926 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  31.16 
 
 
1014 aa  92  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  32.13 
 
 
872 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 
854 aa  92  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 
868 aa  92  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  24.61 
 
 
872 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 
853 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 
887 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  28.4 
 
 
890 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  33.33 
 
 
761 aa  91.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  32.28 
 
 
852 aa  91.7  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>