More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1281 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1281  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 368 aa  751    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 373 aa  252  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 359 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  39.65 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 358 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  39.66 
 
 		 374 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  39.01 
 
 		 359 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  38.9 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 368 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.95 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  38.64 
 
 		 361 aa  238  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  39.84 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  37.4 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  39.84 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  36.57 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  37.81 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  40.72 
 
 		 360 aa  233  6e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 361 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  39.5 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 365 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  40.18 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 368 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  37.91 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 345 aa  229  8e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  35.99 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  39.52 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 364 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  35.99 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 359 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  36.89 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>