More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0559 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
496 aa  1023    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  51.44 
 
 
478 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.59 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  47.84 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  47.62 
 
 
476 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  47 
 
 
498 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  47.41 
 
 
498 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  47.2 
 
 
476 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.12 
 
 
482 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  47 
 
 
498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  47.2 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  46.79 
 
 
476 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  44.58 
 
 
485 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  46.58 
 
 
480 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  47 
 
 
498 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.96 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  46.79 
 
 
480 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  46.58 
 
 
478 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  47.93 
 
 
478 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.95 
 
 
587 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  44.31 
 
 
477 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.86 
 
 
467 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.47 
 
 
488 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.51 
 
 
478 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.79 
 
 
481 aa  391  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  41.2 
 
 
476 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.79 
 
 
477 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  43.38 
 
 
492 aa  386  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.57 
 
 
496 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.13 
 
 
486 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.13 
 
 
486 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.72 
 
 
497 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  41.7 
 
 
484 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39.92 
 
 
484 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.49 
 
 
486 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.49 
 
 
486 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.45 
 
 
487 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.56 
 
 
500 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.1 
 
 
484 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.21 
 
 
485 aa  360  4e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 
499 aa  359  5e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.37 
 
 
491 aa  355  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40 
 
 
475 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.35 
 
 
483 aa  350  4e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.37 
 
 
484 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.63 
 
 
490 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.75 
 
 
491 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.9 
 
 
491 aa  330  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.29 
 
 
475 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 
482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.39 
 
 
482 aa  326  8.000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.24 
 
 
475 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 
477 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.3 
 
 
473 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.11 
 
 
494 aa  324  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.28 
 
 
488 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.5 
 
 
506 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  36.36 
 
 
484 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.24 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.79 
 
 
518 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.11 
 
 
534 aa  312  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.54 
 
 
502 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  36.69 
 
 
501 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.97 
 
 
463 aa  309  8e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.67 
 
 
488 aa  309  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37 
 
 
499 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.9 
 
 
509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.5 
 
 
504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.31 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.94 
 
 
503 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.72 
 
 
491 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  37.07 
 
 
484 aa  300  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.35 
 
 
489 aa  299  8e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.36 
 
 
487 aa  299  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.84 
 
 
490 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.41 
 
 
483 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.45 
 
 
498 aa  296  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  36.8 
 
 
487 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.07 
 
 
495 aa  296  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  36.63 
 
 
486 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.87 
 
 
485 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.16 
 
 
460 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  35.53 
 
 
477 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  35.53 
 
 
477 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  35.53 
 
 
477 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  35.53 
 
 
477 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  35.53 
 
 
477 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  36.79 
 
 
465 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.1 
 
 
493 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.51 
 
 
489 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.42 
 
 
488 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  36.67 
 
 
493 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  37.01 
 
 
513 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  35.33 
 
 
478 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.71 
 
 
507 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.44 
 
 
481 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.73 
 
 
496 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  35.63 
 
 
460 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2803  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.76 
 
 
500 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0129152  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.86 
 
 
489 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>