More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4452 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  80.15 
 
 		 274 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  49.06 
 
 		 276 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  44.87 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  44.28 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  38.76 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.04 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  40.93 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  33.59 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  42.15 
 
 		 382 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  37.5 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  29.71 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.71 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  38.66 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  33.67 
 
 		 776 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  28.23 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  29.88 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.24 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  41.53 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  39.38 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  33.61 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.15 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  32.17 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  30.64 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  20.64 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  24.88 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0755  Methyltransferase type 11  35.84 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.75 
 
 		 418 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  36.94 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.71 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  35.09 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.94 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.1 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  29.94 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.63 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.97 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.02 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.51 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  30.23 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  37.86 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  35.1 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  34.62 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.65 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  33.9 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.46 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.32 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.29 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5061  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 1012 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.45 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  33.9 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  29.89 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.93 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  38.14 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  26.44 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1509  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.5 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>