More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4171 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_09037  periplasmic nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15190)  52.21 
 
 		 1009 aa  844    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4538  molybdopterin oxidoreductase  58.7 
 
 		 830 aa  901    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.104791  normal  0.555476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  58.38 
 
 		 964 aa  909    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2122  molybdopterin oxidoreductase  49.57 
 
 		 814 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.890229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4662  molybdopterin oxidoreductase  62.98 
 
 		 818 aa  971    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.690498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  67.48 
 
 		 834 aa  1059    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  65.12 
 
 		 779 aa  1055    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  57.14 
 
 		 788 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4171  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 776 aa  1595    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0561971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 		 744 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  39.21 
 
 		 762 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  37.87 
 
 		 752 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  35.12 
 
 		 734 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  37.9 
 
 		 752 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  37.6 
 
 		 752 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  36.72 
 
 		 906 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  35.89 
 
 		 908 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  34.1 
 
 		 734 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.65 
 
 		 727 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.62 
 
 		 905 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  36.44 
 
 		 901 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  35.96 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  36.23 
 
 		 906 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.85 
 
 		 951 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.87 
 
 		 904 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  34.86 
 
 		 931 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  34.37 
 
 		 1180 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  33.97 
 
 		 1176 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  33.02 
 
 		 1171 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  34.5 
 
 		 758 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.58 
 
 		 951 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.53 
 
 		 727 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.58 
 
 		 951 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  36.58 
 
 		 951 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  36.72 
 
 		 951 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.58 
 
 		 951 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.31 
 
 		 894 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.45 
 
 		 951 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.45 
 
 		 951 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  35.37 
 
 		 1173 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  35.66 
 
 		 952 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.1 
 
 		 766 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  33.16 
 
 		 946 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  34.64 
 
 		 746 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  33.95 
 
 		 958 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  34.64 
 
 		 746 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 		 955 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.39 
 
 		 952 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.64 
 
 		 734 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.16 
 
 		 904 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.1 
 
 		 986 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.05 
 
 		 907 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1188 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 757 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  34.61 
 
 		 954 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  34.37 
 
 		 724 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.88 
 
 		 674 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 		 953 aa  369  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  33.74 
 
 		 745 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.1 
 
 		 687 aa  369  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.37 
 
 		 688 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  32.74 
 
 		 1003 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.41 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.06 
 
 		 688 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.47 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.47 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.96 
 
 		 688 aa  365  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 		 759 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.07 
 
 		 929 aa  365  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.51 
 
 		 695 aa  364  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.96 
 
 		 688 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  33.42 
 
 		 716 aa  363  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  31.41 
 
 		 687 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  33.92 
 
 		 755 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3054  molybdopterin oxidoreductase  34.19 
 
 		 741 aa  361  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0368144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.28 
 
 		 674 aa  360  7e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  32.36 
 
 		 1228 aa  360  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 		 933 aa  359  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.5 
 
 		 1313 aa  357  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  34.36 
 
 		 1312 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  35.94 
 
 		 1405 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  34.64 
 
 		 1397 aa  354  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  36.22 
 
 		 933 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.96 
 
 		 686 aa  353  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  36.15 
 
 		 706 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.69 
 
 		 899 aa  352  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  34.51 
 
 		 1397 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  35.58 
 
 		 1396 aa  351  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.2 
 
 		 743 aa  349  9e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.65 
 
 		 729 aa  348  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.16 
 
 		 1232 aa  348  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  34.29 
 
 		 708 aa  347  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.51 
 
 		 1395 aa  347  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.42 
 
 		 689 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 1317 aa  345  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  34.55 
 
 		 1395 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  34.55 
 
 		 1395 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  31.46 
 
 		 689 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 		 893 aa  344  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  32.48 
 
 		 743 aa  344  4e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>