More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0418 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0418  ribonuclease H  100 
 
 		 143 aa  289  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  52.31 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  44.22 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  47.06 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  41.73 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  45.99 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  45.26 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  43.38 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  46.04 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  47.45 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  45.26 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  44.53 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  48.15 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  44.93 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  45.26 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  44.14 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  43.48 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  46.04 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  43.8 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  40.43 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  44.68 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  44.93 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  44.78 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  47.76 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  40.71 
 
 		 146 aa  106  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  42.03 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  40.14 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  44.78 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  44.37 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  41.79 
 
 		 269 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  47.1 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  46.62 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  45.52 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  43.57 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  42.65 
 
 		 214 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  44.78 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.65 
 
 		 532 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  45.71 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  44.03 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  46.15 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  44.03 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  44.03 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  44.03 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  44.03 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  44.03 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  43.28 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  44.03 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  42.54 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  43.57 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  43.57 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  40.58 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  42.11 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  46.62 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  40.58 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  43.07 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  42.34 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  44.03 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  44.12 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  41.3 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  41.91 
 
 		 527 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  45.11 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  43.28 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  40.14 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  41.04 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  41.04 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  43.17 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  46.62 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  45.99 
 
 		 252 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  43.88 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  42.34 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  44.76 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  44.53 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  43.07 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  40.74 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  42.45 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  43.8 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  41.35 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  43.48 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  42.45 
 
 		 175 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  41.04 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  41.55 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  44.36 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  43.57 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  42.86 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  42.86 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  43.28 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  43.28 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  44.36 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  38.85 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  41.79 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  41.04 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  41.04 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  44.03 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  41.79 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  41.04 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  44.29 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  39.72 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  43.07 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  43.61 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  45.52 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>