43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0518 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1005    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  59.14 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  59.12 
 
 		 447 aa  497  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  57.38 
 
 		 465 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  54.99 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  55.06 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  55.76 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  42.49 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  40.23 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  28.65 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.26 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 653 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  25.3 
 
 		 653 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  25.3 
 
 		 653 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  30.13 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  32.74 
 
 		 522 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  29.27 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.36 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  24.09 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  28.28 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  29.5 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  31.34 
 
 		 515 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  31.09 
 
 		 465 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  26.72 
 
 		 368 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  28.45 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  21.1 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  30.71 
 
 		 466 aa  47  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  29.6 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  25.45 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  25.57 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  29.1 
 
 		 509 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.78 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  26.5 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  28.37 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  29.79 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  27.33 
 
 		 352 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  28.26 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  28.68 
 
 		 357 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.26 
 
 		 352 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  29.79 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  25.9 
 
 		 328 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  28.48 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  27.48 
 
 		 620 aa  43.1  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>