298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_B2810 on replicon NC_007615
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  58.48 
 
 
228 aa  262  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  58.04 
 
 
228 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  58.04 
 
 
228 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  46.43 
 
 
227 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.4 
 
 
228 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  42.48 
 
 
228 aa  176  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  38.89 
 
 
224 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  39.53 
 
 
226 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.38 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.78 
 
 
232 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  30.71 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.86 
 
 
237 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  36.23 
 
 
219 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  37.61 
 
 
238 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  33.02 
 
 
252 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
229 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
251 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  32.9 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  33.06 
 
 
237 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  32.31 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  28.7 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  28.27 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  34.39 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.19 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  28.89 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.59 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.37 
 
 
309 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.97 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.97 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.97 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.97 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.97 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.97 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.97 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  28.32 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  33.08 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.9 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
223 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.4 
 
 
219 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  21.79 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  24.31 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.54 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  24 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.57 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.68 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.76 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.56 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  24.89 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 
220 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
212 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  24 
 
 
210 aa  52  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.16 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.89 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  25.23 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.32 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.71 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.16 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  25.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  25.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  25.76 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  25.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  25.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  30.2 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.24 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  25.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.19 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  23.31 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>