56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0405 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  32.04 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  29.83 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  27.27 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  30.43 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  28.41 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  27.84 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  30.11 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  27.91 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  28.41 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  27.72 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  29.28 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  28.32 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  26.14 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  28.8 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  26.09 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  26.78 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  25.82 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  26.34 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  27.03 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  27.54 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  27.07 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  27.93 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2381  cytidylate kinase-like  27.27 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  28.57 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  25.75 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  25.53 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  30.23 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  22.94 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  22.09 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  21.51 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  22.09 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  23.2 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4881  hypothetical protein  23.26 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  25.14 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  24.1 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  26.56 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  23.49 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  25.98 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  23.43 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  46.15 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  25 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.73 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  25.64 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  45.45 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  39.13 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  25.27 
 
 		 165 aa  42  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  38.64 
 
 		 215 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  22.29 
 
 		 172 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  26.28 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  24.74 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  26.37 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  45.45 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  43.59 
 
 		 228 aa  41.2  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>