48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1349 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 
525 aa  1068    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  60.59 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  65.22 
 
 
427 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  60.39 
 
 
440 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  53.23 
 
 
467 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  51.69 
 
 
399 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  42.08 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  41.89 
 
 
412 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  37.85 
 
 
404 aa  100  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  36.55 
 
 
346 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  35.81 
 
 
339 aa  93.6  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  39.81 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  32.11 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  34.38 
 
 
404 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  31.22 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.98 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  36.89 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  28.88 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  32.2 
 
 
695 aa  67.8  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  28.35 
 
 
399 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  29.5 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  36.63 
 
 
386 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  30.6 
 
 
349 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  28.03 
 
 
387 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  31.2 
 
 
439 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  26.72 
 
 
356 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  26.52 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  26.52 
 
 
387 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  26.52 
 
 
387 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  26.52 
 
 
360 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  27.09 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  27.12 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  27.12 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  26.67 
 
 
416 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  25.85 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  28.09 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  27.06 
 
 
1145 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  32.14 
 
 
327 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  33.59 
 
 
333 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  27.14 
 
 
411 aa  47.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  31.03 
 
 
359 aa  47  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  28.95 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_11  predicted protein  28.43 
 
 
1994 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  35.9 
 
 
734 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  32.93 
 
 
379 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04690  3-methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containig subunit3-methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit (EC 6.4.1.4);(EC 6.4.1.4) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L7]  40.35 
 
 
712 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403972  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5868  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  27.03 
 
 
462 aa  43.5  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>