More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3041 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  100 
 
 		 350 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  59.7 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  55.52 
 
 		 345 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  55.81 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  57.06 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  57.23 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  52.24 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  48.39 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  49.55 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  48.68 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  48.35 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  48.06 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  46.57 
 
 		 328 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  43.93 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  45.51 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  43.37 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  44.24 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  44.11 
 
 		 340 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  43.84 
 
 		 370 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  43.32 
 
 		 371 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  42.53 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  37.31 
 
 		 351 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  35.65 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  36.04 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  34.94 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  36.45 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  31.28 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 517 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  34.91 
 
 		 517 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  31.88 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  32.42 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 353 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.96 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.23 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.72 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.23 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.92 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  34.28 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.1 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  31.63 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.18 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  34.24 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  30.42 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  28.65 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  28.36 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  31.97 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  30.19 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  32.45 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.95 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  29.38 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  28.49 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.81 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.62 
 
 		 337 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.59 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.41 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.1 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 		 360 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  24.85 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  25.79 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.12 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  25.15 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.81 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  28.12 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  26.41 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>