More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2329 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  100 
 
 		 399 aa  801    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  78.77 
 
 		 393 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  67.78 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  66.92 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  67.01 
 
 		 388 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  66.41 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  65.13 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  53.16 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  52.52 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  52.52 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  51.57 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  50.79 
 
 		 386 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  50.52 
 
 		 388 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  52.49 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  47.66 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 402 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  48.69 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  44.21 
 
 		 382 aa  296  6e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  48.31 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  47.37 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  45.53 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  49.46 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  47.66 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  48.81 
 
 		 368 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  47.66 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  47.23 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  51.51 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.77 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  41.22 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  41.78 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.43 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  45.5 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  42.2 
 
 		 398 aa  269  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.3 
 
 		 401 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.35 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.72 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 384 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 392 aa  266  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  43.77 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 401 aa  265  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  37.57 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.41 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  45 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  44.59 
 
 		 1143 aa  262  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.73 
 
 		 392 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.55 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.12 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  43.5 
 
 		 1139 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  44.74 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  44.83 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  45.8 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  37.07 
 
 		 492 aa  255  8e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  37.6 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  46.07 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  41.86 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  46.09 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 533 aa  252  6e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.27 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.13 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.05 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.82 
 
 		 381 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.62 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  37.56 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.17 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  45.5 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  44.05 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  37.83 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.89 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  37.31 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  37.56 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  37.27 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  37.31 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.97 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  37.27 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  37.31 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  44.72 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.76 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  37.31 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  43.63 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  42.12 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  46.61 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  40.46 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  44.24 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.41 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  44.14 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  42.06 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.53 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.53 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  41.64 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  36.75 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.96 
 
 		 381 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  43.21 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>